Geographe Bay sirve como un corredor de descanso crítico para las ballenas jorobadas que recorren la ruta de 10.000 kilómetros entre las zonas de alimentación de la Antártida y las aguas tropicales de cría frente a la costa de Kimberley. Entre finales de mayo y principios de diciembre, las manadas permanecen en el canal de 40 metros de profundidad de la bahía para amamantar a sus crías, realizar saltos sincronizados y descansar antes del empuje final hacia el sur. El arco protegido de agua entre Cape Naturaliste y Bunker Bay crea un anfiteatro natural donde la actividad en la superficie permanece visible desde distancias superiores a los dos kilómetros, y la ausencia de corrientes fuertes permite que las madres y las crías se muevan a un ritmo pausado, algo poco común en las rutas migratorias de alta mar. La posición de Dunsborough en la costa norte de la bahía sitúa los puntos de salida a menos de quince minutos de las zonas documentadas de concentración de cetáceos, lo que reduce el tiempo de tránsito y maximiza las ventanas de observación en el agua. Los operadores zarpan desde el Professional Fishermans Boat Ramp en Quindalup, una instalación de superficie dura que acomoda embarcaciones desde inflables rígidos hasta catamaranes de doble casco. La orientación este de la rampa ofrece refugio matutino contra los vientos predominantes del suroeste, y el aparcamiento adyacente tiene capacidad para sesenta vehículos, con acceso adicional durante las semanas pico de migración en septiembre y octubre. Geographe Bay Road conecta el sitio de lanzamiento con la Bussell Highway a través de una ruta sellada de dos carriles, y hay señalización direccional tanto en el cruce de Caves Road como en el desvío hacia la ciudad de Quindalup. Los avistamientos de mamíferos marinos en la bahía siguen patrones estacionales predecibles documentados por el Departamento de Biodiversidad, Conservación y Atracciones desde 1989. La migración hacia el norte ocurre desde finales de mayo hasta julio, caracterizada por velocidades de viaje más rápidas y preferencias por aguas más profundas, ya que las ballenas priorizan la eficiencia calórica. La migración de regreso hacia el sur domina de agosto a noviembre, con las madres y las crías recién nacidas permaneciendo en la bahía por períodos prolongados para acumular reservas de grasa antes de cruzar el Océano Austral. La presencia máxima de crías ocurre a mediados de septiembre, cuando los saltos en superficie, los golpes de aleta pectoral y el comportamiento de espionaje (spy-hopping) alcanzan sus máximos anuales. Los operadores mantienen una zona de exclusión obligatoria de 100 metros bajo las directrices de interacción con mamíferos marinos de la Commonwealth, aunque las ballenas a menudo se acercan a las embarcaciones a distancias más cortas por voluntad propia, particularmente los juveniles y subadultos curiosos. Un tour de avistamiento de ballenas en Dunsborough sale dos veces al día durante los meses de migración, con salidas matutinas entre las 09:45 y las 10:15 para aprovechar las condiciones de viento más tranquilas, y salidas por la tarde programadas para las 13:30 para coincidir con la mayor actividad de las ballenas a medida que suben las temperaturas del agua. La duración de los tours varía de dos horas y media a cuatro horas dependiendo de las distancias de avistamiento y las condiciones meteorológicas, y las embarcaciones llevan hidrófonos para amplificar las vocalizaciones submarinas durante los períodos de descanso cuando disminuye el comportamiento en superficie. La proximidad de la bahía a las aguas más profundas de la plataforma continental significa que las ballenas francas australes, las orcas y las ballenas piloto aparecen como especies secundarias en aproximadamente uno de cada doce cruceros, y los delfines mulares viajan junto a los barcos en más de la mitad de todas las salidas entre octubre y marzo.